Protein–RNA interactions for Protein: O88307

Sorl1, Sortilin-related receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorl1O88307 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sorl1O88307 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sorl1O88307 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sorl1O88307 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sorl1O88307 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sorl1O88307 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sorl1O88307 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sorl1O88307 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sorl1O88307 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sorl1O88307 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sorl1O88307 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sorl1O88307 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sorl1O88307 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms