Protein–RNA interactions for Protein: O70589

Cask, Peripheral plasma membrane protein CASK, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaskO70589 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CaskO70589 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CaskO70589 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CaskO70589 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CaskO70589 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CaskO70589 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CaskO70589 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CaskO70589 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CaskO70589 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CaskO70589 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CaskO70589 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CaskO70589 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CaskO70589 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CaskO70589 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CaskO70589 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CaskO70589 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CaskO70589 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CaskO70589 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CaskO70589 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CaskO70589 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CaskO70589 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CaskO70589 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CaskO70589 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CaskO70589 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CaskO70589 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CaskO70589 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CaskO70589 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CaskO70589 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CaskO70589 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CaskO70589 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CaskO70589 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CaskO70589 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CaskO70589 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CaskO70589 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CaskO70589 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CaskO70589 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CaskO70589 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CaskO70589 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CaskO70589 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CaskO70589 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CaskO70589 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CaskO70589 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CaskO70589 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CaskO70589 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CaskO70589 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CaskO70589 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CaskO70589 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CaskO70589 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CaskO70589 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CaskO70589 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CaskO70589 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CaskO70589 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CaskO70589 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CaskO70589 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CaskO70589 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CaskO70589 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CaskO70589 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CaskO70589 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CaskO70589 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CaskO70589 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CaskO70589 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CaskO70589 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CaskO70589 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CaskO70589 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CaskO70589 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CaskO70589 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CaskO70589 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CaskO70589 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CaskO70589 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CaskO70589 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CaskO70589 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CaskO70589 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CaskO70589 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CaskO70589 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CaskO70589 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CaskO70589 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CaskO70589 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CaskO70589 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CaskO70589 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CaskO70589 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CaskO70589 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CaskO70589 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CaskO70589 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CaskO70589 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CaskO70589 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CaskO70589 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CaskO70589 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CaskO70589 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CaskO70589 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CaskO70589 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CaskO70589 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CaskO70589 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CaskO70589 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CaskO70589 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CaskO70589 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CaskO70589 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CaskO70589 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CaskO70589 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CaskO70589 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CaskO70589 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms