Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms