Protein–RNA interactions for Protein: O55003

Bnip3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip3O55003 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bnip3O55003 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bnip3O55003 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bnip3O55003 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bnip3O55003 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bnip3O55003 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bnip3O55003 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bnip3O55003 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bnip3O55003 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bnip3O55003 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bnip3O55003 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bnip3O55003 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bnip3O55003 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bnip3O55003 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Bnip3O55003 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bnip3O55003 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bnip3O55003 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bnip3O55003 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Bnip3O55003 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bnip3O55003 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bnip3O55003 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bnip3O55003 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Bnip3O55003 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Bnip3O55003 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Bnip3O55003 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bnip3O55003 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms