Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pole2O54956 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pole2O54956 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms