Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sema6bO54951 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sema6bO54951 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sema6bO54951 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sema6bO54951 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sema6bO54951 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sema6bO54951 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sema6bO54951 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sema6bO54951 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sema6bO54951 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sema6bO54951 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sema6bO54951 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sema6bO54951 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sema6bO54951 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sema6bO54951 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sema6bO54951 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sema6bO54951 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sema6bO54951 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sema6bO54951 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sema6bO54951 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sema6bO54951 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sema6bO54951 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sema6bO54951 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sema6bO54951 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sema6bO54951 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sema6bO54951 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sema6bO54951 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sema6bO54951 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sema6bO54951 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sema6bO54951 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sema6bO54951 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sema6bO54951 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sema6bO54951 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sema6bO54951 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sema6bO54951 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sema6bO54951 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sema6bO54951 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sema6bO54951 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sema6bO54951 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Sema6bO54951 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sema6bO54951 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sema6bO54951 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Sema6bO54951 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sema6bO54951 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sema6bO54951 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sema6bO54951 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sema6bO54951 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sema6bO54951 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sema6bO54951 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sema6bO54951 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sema6bO54951 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sema6bO54951 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sema6bO54951 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sema6bO54951 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sema6bO54951 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sema6bO54951 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sema6bO54951 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sema6bO54951 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sema6bO54951 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sema6bO54951 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Sema6bO54951 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sema6bO54951 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sema6bO54951 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Sema6bO54951 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sema6bO54951 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Sema6bO54951 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sema6bO54951 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Sema6bO54951 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sema6bO54951 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sema6bO54951 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sema6bO54951 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sema6bO54951 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sema6bO54951 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sema6bO54951 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Sema6bO54951 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sema6bO54951 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Sema6bO54951 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sema6bO54951 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sema6bO54951 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sema6bO54951 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sema6bO54951 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sema6bO54951 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Sema6bO54951 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sema6bO54951 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sema6bO54951 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sema6bO54951 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Sema6bO54951 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sema6bO54951 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sema6bO54951 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sema6bO54951 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sema6bO54951 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sema6bO54951 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sema6bO54951 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sema6bO54951 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sema6bO54951 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Sema6bO54951 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Sema6bO54951 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sema6bO54951 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sema6bO54951 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sema6bO54951 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms