Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
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Sp100O35892 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sp100O35892 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sp100O35892 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sp100O35892 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sp100O35892 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sp100O35892 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sp100O35892 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp100O35892 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp100O35892 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp100O35892 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp100O35892 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp100O35892 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp100O35892 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp100O35892 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp100O35892 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp100O35892 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp100O35892 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp100O35892 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp100O35892 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp100O35892 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp100O35892 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp100O35892 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp100O35892 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sp100O35892 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sp100O35892 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sp100O35892 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sp100O35892 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Sp100O35892 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sp100O35892 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sp100O35892 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sp100O35892 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Sp100O35892 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp100O35892 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Sp100O35892 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Sp100O35892 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Sp100O35892 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Sp100O35892 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp100O35892 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp100O35892 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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