Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms