Protein–RNA interactions for Protein: O35235

Tnfsf11, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf11O35235 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf11O35235 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf11O35235 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf11O35235 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf11O35235 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf11O35235 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf11O35235 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf11O35235 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf11O35235 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf11O35235 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf11O35235 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf11O35235 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf11O35235 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf11O35235 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf11O35235 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf11O35235 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf11O35235 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf11O35235 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf11O35235 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf11O35235 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf11O35235 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf11O35235 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf11O35235 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms