Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Dctn1O08788 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms