Protein–RNA interactions for Protein: O08785

Clock, Circadian locomoter output cycles protein kaput, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClockO08785 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClockO08785 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClockO08785 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClockO08785 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClockO08785 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClockO08785 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClockO08785 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClockO08785 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClockO08785 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClockO08785 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClockO08785 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClockO08785 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClockO08785 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClockO08785 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClockO08785 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClockO08785 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClockO08785 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClockO08785 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClockO08785 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClockO08785 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClockO08785 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClockO08785 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClockO08785 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClockO08785 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClockO08785 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClockO08785 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClockO08785 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClockO08785 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClockO08785 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClockO08785 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClockO08785 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClockO08785 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClockO08785 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClockO08785 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClockO08785 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClockO08785 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClockO08785 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClockO08785 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClockO08785 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClockO08785 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClockO08785 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClockO08785 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClockO08785 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClockO08785 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClockO08785 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClockO08785 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClockO08785 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClockO08785 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClockO08785 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ClockO08785 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClockO08785 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClockO08785 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClockO08785 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClockO08785 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClockO08785 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClockO08785 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClockO08785 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClockO08785 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClockO08785 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClockO08785 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ClockO08785 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClockO08785 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ClockO08785 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClockO08785 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClockO08785 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClockO08785 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClockO08785 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClockO08785 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClockO08785 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClockO08785 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClockO08785 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClockO08785 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClockO08785 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClockO08785 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClockO08785 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClockO08785 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ClockO08785 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClockO08785 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClockO08785 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClockO08785 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClockO08785 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClockO08785 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClockO08785 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClockO08785 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClockO08785 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClockO08785 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClockO08785 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClockO08785 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClockO08785 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClockO08785 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClockO08785 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClockO08785 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClockO08785 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClockO08785 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClockO08785 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClockO08785 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClockO08785 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClockO08785 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClockO08785 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClockO08785 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms