Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ascl4M0QW46 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ascl4M0QW46 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ascl4M0QW46 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ascl4M0QW46 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ascl4M0QW46 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ascl4M0QW46 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ascl4M0QW46 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ascl4M0QW46 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ascl4M0QW46 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ascl4M0QW46 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ascl4M0QW46 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ascl4M0QW46 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ascl4M0QW46 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ascl4M0QW46 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ascl4M0QW46 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ascl4M0QW46 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ascl4M0QW46 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms