Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vwa3bJ9JI28 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vwa3bJ9JI28 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vwa3bJ9JI28 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vwa3bJ9JI28 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms