Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5849J3QPE5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms