Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm19965J3QNY8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm19965J3QNY8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm19965J3QNY8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm19965J3QNY8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm19965J3QNY8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm19965J3QNY8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm19965J3QNY8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm19965J3QNY8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm19965J3QNY8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm19965J3QNY8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm19965J3QNY8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm19965J3QNY8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm19965J3QNY8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm19965J3QNY8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm19965J3QNY8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm19965J3QNY8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm19965J3QNY8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm19965J3QNY8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm19965J3QNY8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm19965J3QNY8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Gm19965J3QNY8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Gm19965J3QNY8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Gm19965J3QNY8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Gm19965J3QNY8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Gm19965J3QNY8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm19965J3QNY8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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