Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20830J3KML6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20830J3KML6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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