Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pot1bH7BX60 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pot1bH7BX60 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pot1bH7BX60 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pot1bH7BX60 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pot1bH7BX60 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pot1bH7BX60 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pot1bH7BX60 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pot1bH7BX60 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pot1bH7BX60 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pot1bH7BX60 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pot1bH7BX60 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Pot1bH7BX60 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pot1bH7BX60 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pot1bH7BX60 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pot1bH7BX60 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pot1bH7BX60 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pot1bH7BX60 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pot1bH7BX60 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pot1bH7BX60 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Pot1bH7BX60 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pot1bH7BX60 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pot1bH7BX60 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pot1bH7BX60 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pot1bH7BX60 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pot1bH7BX60 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pot1bH7BX60 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pot1bH7BX60 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pot1bH7BX60 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pot1bH7BX60 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pot1bH7BX60 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pot1bH7BX60 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pot1bH7BX60 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pot1bH7BX60 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pot1bH7BX60 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pot1bH7BX60 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pot1bH7BX60 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pot1bH7BX60 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pot1bH7BX60 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pot1bH7BX60 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pot1bH7BX60 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pot1bH7BX60 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pot1bH7BX60 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pot1bH7BX60 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pot1bH7BX60 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pot1bH7BX60 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pot1bH7BX60 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pot1bH7BX60 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pot1bH7BX60 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pot1bH7BX60 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms