Protein–RNA interactions for Protein: G3UXD1

Speer4c, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4cG3UXD1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms