Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r167G3UW71 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms