Protein–RNA interactions for Protein: G3UW59

Ubap1l, MCG16443, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubap1lG3UW59 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ubap1lG3UW59 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ubap1lG3UW59 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ubap1lG3UW59 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ubap1lG3UW59 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ubap1lG3UW59 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ubap1lG3UW59 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ubap1lG3UW59 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ubap1lG3UW59 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ubap1lG3UW59 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ubap1lG3UW59 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ubap1lG3UW59 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ubap1lG3UW59 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ubap1lG3UW59 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ubap1lG3UW59 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ubap1lG3UW59 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ubap1lG3UW59 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ubap1lG3UW59 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ubap1lG3UW59 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ubap1lG3UW59 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ubap1lG3UW59 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ubap1lG3UW59 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ubap1lG3UW59 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ubap1lG3UW59 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ubap1lG3UW59 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ubap1lG3UW59 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ubap1lG3UW59 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ubap1lG3UW59 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ubap1lG3UW59 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ubap1lG3UW59 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ubap1lG3UW59 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ubap1lG3UW59 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ubap1lG3UW59 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ubap1lG3UW59 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ubap1lG3UW59 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ubap1lG3UW59 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ubap1lG3UW59 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ubap1lG3UW59 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ubap1lG3UW59 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ubap1lG3UW59 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ubap1lG3UW59 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubap1lG3UW59 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubap1lG3UW59 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubap1lG3UW59 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubap1lG3UW59 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubap1lG3UW59 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubap1lG3UW59 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubap1lG3UW59 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubap1lG3UW59 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubap1lG3UW59 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms