Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ88

Gm5145, Predicted pseudogene 5145, mousemouse

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5145F8VQ88 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Gm5145F8VQ88 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Gm5145F8VQ88 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Gm5145F8VQ88 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5145F8VQ88 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5145F8VQ88 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5145F8VQ88 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5145F8VQ88 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5145F8VQ88 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5145F8VQ88 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5145F8VQ88 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5145F8VQ88 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5145F8VQ88 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5145F8VQ88 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5145F8VQ88 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5145F8VQ88 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5145F8VQ88 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5145F8VQ88 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5145F8VQ88 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5145F8VQ88 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5145F8VQ88 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5145F8VQ88 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5145F8VQ88 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5145F8VQ88 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5145F8VQ88 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5145F8VQ88 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5145F8VQ88 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5145F8VQ88 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5145F8VQ88 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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