Protein–RNA interactions for Protein: F6ZZG8

Gm5624, Predicted gene 5624 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5624F6ZZG8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm5624F6ZZG8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5624F6ZZG8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5624F6ZZG8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5624F6ZZG8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5624F6ZZG8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5624F6ZZG8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5624F6ZZG8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5624F6ZZG8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5624F6ZZG8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5624F6ZZG8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5624F6ZZG8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5624F6ZZG8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5624F6ZZG8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5624F6ZZG8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5624F6ZZG8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5624F6ZZG8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5624F6ZZG8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5624F6ZZG8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5624F6ZZG8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5624F6ZZG8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5624F6ZZG8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5624F6ZZG8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5624F6ZZG8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5624F6ZZG8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5624F6ZZG8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms