Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933403O08RikF6UK53 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms