Protein–RNA interactions for Protein: F6SG70

Gm28374, Predicted gene 28374 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28374F6SG70 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28374F6SG70 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28374F6SG70 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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