Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc7bE9Q9Y3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms