Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8N6

Aknad1, AKNA domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aknad1E9Q8N6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Aknad1E9Q8N6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Aknad1E9Q8N6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Aknad1E9Q8N6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Aknad1E9Q8N6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Aknad1E9Q8N6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Aknad1E9Q8N6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Aknad1E9Q8N6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Aknad1E9Q8N6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Aknad1E9Q8N6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Aknad1E9Q8N6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Aknad1E9Q8N6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Aknad1E9Q8N6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Aknad1E9Q8N6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Aknad1E9Q8N6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Aknad1E9Q8N6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Aknad1E9Q8N6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Aknad1E9Q8N6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Aknad1E9Q8N6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Aknad1E9Q8N6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Aknad1E9Q8N6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Aknad1E9Q8N6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Aknad1E9Q8N6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Aknad1E9Q8N6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Aknad1E9Q8N6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Aknad1E9Q8N6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Aknad1E9Q8N6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Aknad1E9Q8N6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Aknad1E9Q8N6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Aknad1E9Q8N6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Aknad1E9Q8N6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Aknad1E9Q8N6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Aknad1E9Q8N6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Aknad1E9Q8N6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Aknad1E9Q8N6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Aknad1E9Q8N6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Aknad1E9Q8N6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Aknad1E9Q8N6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Aknad1E9Q8N6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Aknad1E9Q8N6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Aknad1E9Q8N6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Aknad1E9Q8N6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Aknad1E9Q8N6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Aknad1E9Q8N6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Aknad1E9Q8N6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Aknad1E9Q8N6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Aknad1E9Q8N6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms