Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Col22a1E9Q7P1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col22a1E9Q7P1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Col22a1E9Q7P1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col22a1E9Q7P1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col22a1E9Q7P1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col22a1E9Q7P1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col22a1E9Q7P1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col22a1E9Q7P1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col22a1E9Q7P1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col22a1E9Q7P1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col22a1E9Q7P1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col22a1E9Q7P1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col22a1E9Q7P1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col22a1E9Q7P1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col22a1E9Q7P1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col22a1E9Q7P1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col22a1E9Q7P1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col22a1E9Q7P1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col22a1E9Q7P1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col22a1E9Q7P1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col22a1E9Q7P1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col22a1E9Q7P1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col22a1E9Q7P1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms