Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L2

Pi4ka, Phosphatidylinositol 4-kinase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pi4kaE9Q3L2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pi4kaE9Q3L2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pi4kaE9Q3L2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pi4kaE9Q3L2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pi4kaE9Q3L2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pi4kaE9Q3L2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pi4kaE9Q3L2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pi4kaE9Q3L2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pi4kaE9Q3L2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pi4kaE9Q3L2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pi4kaE9Q3L2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Pi4kaE9Q3L2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pi4kaE9Q3L2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pi4kaE9Q3L2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pi4kaE9Q3L2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pi4kaE9Q3L2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pi4kaE9Q3L2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pi4kaE9Q3L2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pi4kaE9Q3L2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pi4kaE9Q3L2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pi4kaE9Q3L2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pi4kaE9Q3L2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pi4kaE9Q3L2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pi4kaE9Q3L2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pi4kaE9Q3L2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pi4kaE9Q3L2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pi4kaE9Q3L2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Pi4kaE9Q3L2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pi4kaE9Q3L2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pi4kaE9Q3L2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pi4kaE9Q3L2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pi4kaE9Q3L2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pi4kaE9Q3L2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Pi4kaE9Q3L2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms