Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1P8

Irf2bp2, Interferon regulatory factor 2-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf2bp2E9Q1P8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf2bp2E9Q1P8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf2bp2E9Q1P8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf2bp2E9Q1P8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf2bp2E9Q1P8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf2bp2E9Q1P8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf2bp2E9Q1P8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf2bp2E9Q1P8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf2bp2E9Q1P8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf2bp2E9Q1P8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf2bp2E9Q1P8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf2bp2E9Q1P8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf2bp2E9Q1P8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf2bp2E9Q1P8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf2bp2E9Q1P8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf2bp2E9Q1P8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf2bp2E9Q1P8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf2bp2E9Q1P8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf2bp2E9Q1P8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf2bp2E9Q1P8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf2bp2E9Q1P8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf2bp2E9Q1P8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf2bp2E9Q1P8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf2bp2E9Q1P8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf2bp2E9Q1P8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms