Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Scaf11E9PZM7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Scaf11E9PZM7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Scaf11E9PZM7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Scaf11E9PZM7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Scaf11E9PZM7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Scaf11E9PZM7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Scaf11E9PZM7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Scaf11E9PZM7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Scaf11E9PZM7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Scaf11E9PZM7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Scaf11E9PZM7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Scaf11E9PZM7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Scaf11E9PZM7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Scaf11E9PZM7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Scaf11E9PZM7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Scaf11E9PZM7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Scaf11E9PZM7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Scaf11E9PZM7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Scaf11E9PZM7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Scaf11E9PZM7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Scaf11E9PZM7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Scaf11E9PZM7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Scaf11E9PZM7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Scaf11E9PZM7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Scaf11E9PZM7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Scaf11E9PZM7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Scaf11E9PZM7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Scaf11E9PZM7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Scaf11E9PZM7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Scaf11E9PZM7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Scaf11E9PZM7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Scaf11E9PZM7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Scaf11E9PZM7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Scaf11E9PZM7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Scaf11E9PZM7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Scaf11E9PZM7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Scaf11E9PZM7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Scaf11E9PZM7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Scaf11E9PZM7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Scaf11E9PZM7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Scaf11E9PZM7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Scaf11E9PZM7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Scaf11E9PZM7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Scaf11E9PZM7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Scaf11E9PZM7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Scaf11E9PZM7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Scaf11E9PZM7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Scaf11E9PZM7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Scaf11E9PZM7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Scaf11E9PZM7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Scaf11E9PZM7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Scaf11E9PZM7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Scaf11E9PZM7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Scaf11E9PZM7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Scaf11E9PZM7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Scaf11E9PZM7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms