Protein–RNA interactions for Protein: E9PWZ2

Scgb1b20, ABPA20, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb1b20E9PWZ2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb1b20E9PWZ2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb1b20E9PWZ2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb1b20E9PWZ2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb1b20E9PWZ2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb1b20E9PWZ2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb1b20E9PWZ2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb1b20E9PWZ2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb1b20E9PWZ2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb1b20E9PWZ2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb1b20E9PWZ2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb1b20E9PWZ2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb1b20E9PWZ2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb1b20E9PWZ2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb1b20E9PWZ2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb1b20E9PWZ2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb1b20E9PWZ2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb1b20E9PWZ2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb1b20E9PWZ2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb1b20E9PWZ2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb1b20E9PWZ2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb1b20E9PWZ2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb1b20E9PWZ2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scgb1b20E9PWZ2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scgb1b20E9PWZ2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scgb1b20E9PWZ2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scgb1b20E9PWZ2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scgb1b20E9PWZ2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scgb1b20E9PWZ2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms