Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms