Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BC048679D3YXE9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms