Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Gm17333C6EQI3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Gm17333C6EQI3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Gm17333C6EQI3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Gm17333C6EQI3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gm17333C6EQI3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gm17333C6EQI3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Gm17333C6EQI3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gm17333C6EQI3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17333C6EQI3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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