Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CatipB9EKE5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CatipB9EKE5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CatipB9EKE5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CatipB9EKE5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CatipB9EKE5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CatipB9EKE5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CatipB9EKE5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CatipB9EKE5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CatipB9EKE5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CatipB9EKE5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CatipB9EKE5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CatipB9EKE5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CatipB9EKE5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CatipB9EKE5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CatipB9EKE5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CatipB9EKE5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CatipB9EKE5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CatipB9EKE5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CatipB9EKE5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CatipB9EKE5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CatipB9EKE5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CatipB9EKE5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CatipB9EKE5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CatipB9EKE5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CatipB9EKE5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CatipB9EKE5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CatipB9EKE5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CatipB9EKE5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CatipB9EKE5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CatipB9EKE5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CatipB9EKE5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CatipB9EKE5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CatipB9EKE5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CatipB9EKE5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CatipB9EKE5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CatipB9EKE5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CatipB9EKE5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CatipB9EKE5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CatipB9EKE5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms