Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzd8B9EJ80 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms