Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf11cB4XVP9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms