Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Siah3B2RWG3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Siah3B2RWG3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms