Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Clrn2B2RVW2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms