Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slfn8B1ARD8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms