Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm6880A3KG45 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm6880A3KG45 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm6880A3KG45 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm6880A3KG45 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm6880A3KG45 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm6880A3KG45 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm6880A3KG45 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm6880A3KG45 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm6880A3KG45 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm6880A3KG45 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm6880A3KG45 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm6880A3KG45 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm6880A3KG45 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm6880A3KG45 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm6880A3KG45 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm6880A3KG45 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm6880A3KG45 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm6880A3KG45 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm6880A3KG45 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm6880A3KG45 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm6880A3KG45 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm6880A3KG45 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm6880A3KG45 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm6880A3KG45 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm6880A3KG45 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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