Protein–RNA interactions for Protein: A2RSL7

4931406B18Rik, RIKEN cDNA 4931406B18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931406B18RikA2RSL7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
4931406B18RikA2RSL7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms