Protein–RNA interactions for Protein: A2ALW2

Zkscan16, Zinc finger with KRAB and SCAN domains 16, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan16A2ALW2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zkscan16A2ALW2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms