Protein–RNA interactions for Protein: A2AGX3

Prdm11, PR domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm11A2AGX3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Prdm11A2AGX3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Prdm11A2AGX3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prdm11A2AGX3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prdm11A2AGX3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prdm11A2AGX3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prdm11A2AGX3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prdm11A2AGX3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prdm11A2AGX3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prdm11A2AGX3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prdm11A2AGX3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prdm11A2AGX3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prdm11A2AGX3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prdm11A2AGX3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prdm11A2AGX3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prdm11A2AGX3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prdm11A2AGX3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prdm11A2AGX3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prdm11A2AGX3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prdm11A2AGX3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prdm11A2AGX3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prdm11A2AGX3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prdm11A2AGX3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prdm11A2AGX3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prdm11A2AGX3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prdm11A2AGX3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prdm11A2AGX3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prdm11A2AGX3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Prdm11A2AGX3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prdm11A2AGX3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prdm11A2AGX3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prdm11A2AGX3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prdm11A2AGX3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prdm11A2AGX3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prdm11A2AGX3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prdm11A2AGX3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prdm11A2AGX3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prdm11A2AGX3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prdm11A2AGX3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prdm11A2AGX3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prdm11A2AGX3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prdm11A2AGX3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Prdm11A2AGX3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prdm11A2AGX3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Prdm11A2AGX3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prdm11A2AGX3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prdm11A2AGX3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prdm11A2AGX3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prdm11A2AGX3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prdm11A2AGX3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prdm11A2AGX3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prdm11A2AGX3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prdm11A2AGX3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Prdm11A2AGX3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prdm11A2AGX3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prdm11A2AGX3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prdm11A2AGX3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prdm11A2AGX3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prdm11A2AGX3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prdm11A2AGX3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prdm11A2AGX3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prdm11A2AGX3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Prdm11A2AGX3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prdm11A2AGX3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prdm11A2AGX3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prdm11A2AGX3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prdm11A2AGX3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prdm11A2AGX3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prdm11A2AGX3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Prdm11A2AGX3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prdm11A2AGX3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prdm11A2AGX3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prdm11A2AGX3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prdm11A2AGX3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prdm11A2AGX3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prdm11A2AGX3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prdm11A2AGX3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prdm11A2AGX3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prdm11A2AGX3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prdm11A2AGX3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prdm11A2AGX3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prdm11A2AGX3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prdm11A2AGX3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prdm11A2AGX3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms