Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgb4A2A863 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgb4A2A863 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgb4A2A863 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgb4A2A863 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgb4A2A863 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgb4A2A863 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgb4A2A863 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itgb4A2A863 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itgb4A2A863 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itgb4A2A863 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itgb4A2A863 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Itgb4A2A863 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itgb4A2A863 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itgb4A2A863 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itgb4A2A863 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itgb4A2A863 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itgb4A2A863 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Itgb4A2A863 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Itgb4A2A863 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Itgb4A2A863 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Itgb4A2A863 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itgb4A2A863 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itgb4A2A863 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itgb4A2A863 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itgb4A2A863 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itgb4A2A863 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itgb4A2A863 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itgb4A2A863 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itgb4A2A863 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgb4A2A863 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgb4A2A863 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgb4A2A863 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgb4A2A863 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgb4A2A863 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgb4A2A863 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgb4A2A863 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgb4A2A863 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgb4A2A863 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgb4A2A863 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgb4A2A863 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgb4A2A863 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itgb4A2A863 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itgb4A2A863 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itgb4A2A863 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itgb4A2A863 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itgb4A2A863 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itgb4A2A863 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itgb4A2A863 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itgb4A2A863 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itgb4A2A863 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Itgb4A2A863 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itgb4A2A863 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itgb4A2A863 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itgb4A2A863 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itgb4A2A863 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itgb4A2A863 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Itgb4A2A863 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Itgb4A2A863 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itgb4A2A863 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Itgb4A2A863 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itgb4A2A863 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Itgb4A2A863 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Itgb4A2A863 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Itgb4A2A863 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Itgb4A2A863 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Itgb4A2A863 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Itgb4A2A863 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itgb4A2A863 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itgb4A2A863 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itgb4A2A863 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itgb4A2A863 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itgb4A2A863 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itgb4A2A863 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itgb4A2A863 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itgb4A2A863 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itgb4A2A863 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itgb4A2A863 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itgb4A2A863 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itgb4A2A863 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itgb4A2A863 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itgb4A2A863 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itgb4A2A863 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itgb4A2A863 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itgb4A2A863 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itgb4A2A863 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itgb4A2A863 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itgb4A2A863 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itgb4A2A863 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itgb4A2A863 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itgb4A2A863 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itgb4A2A863 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itgb4A2A863 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itgb4A2A863 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itgb4A2A863 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itgb4A2A863 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itgb4A2A863 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itgb4A2A863 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itgb4A2A863 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Itgb4A2A863 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms