Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Fam71e1A1L3C1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms