Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc173A0JLY1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms