Protein–RNA interactions for Protein: A0AUP1

Ccdc112, Coiled-coil domain-containing protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc112A0AUP1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc112A0AUP1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc112A0AUP1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc112A0AUP1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc112A0AUP1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc112A0AUP1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc112A0AUP1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc112A0AUP1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc112A0AUP1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc112A0AUP1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc112A0AUP1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc112A0AUP1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc112A0AUP1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc112A0AUP1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc112A0AUP1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc112A0AUP1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc112A0AUP1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc112A0AUP1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc112A0AUP1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc112A0AUP1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc112A0AUP1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc112A0AUP1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc112A0AUP1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc112A0AUP1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc112A0AUP1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc112A0AUP1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc112A0AUP1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc112A0AUP1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc112A0AUP1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc112A0AUP1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc112A0AUP1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc112A0AUP1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc112A0AUP1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc112A0AUP1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc112A0AUP1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc112A0AUP1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc112A0AUP1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc112A0AUP1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc112A0AUP1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc112A0AUP1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc112A0AUP1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc112A0AUP1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc112A0AUP1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc112A0AUP1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc112A0AUP1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms