Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms