Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVH3

AU041133, Expressed sequence AU041133, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU041133A0A0J9YVH3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AU041133A0A0J9YVH3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms